인유두종바이러스(HPV)가 미국에서 두경부암의 약 70%를 유발하며, 특히 HPV 관련 구인두암과 편도암의 발생률이 꾸준히 증가하고 있다. 그러나 현재 HPV 관련 두경부암에 대한 선별 검사는 없어 대부분 환자는 종양이 상당히 성장하고 림프절로 전이된 뒤 증상이 나타나 병원을 찾는다. 이 때문에 조기 발견의 기회가 제한되며, 치료 과정에서 심각한 부작용을 겪을 가능성이 높다.
최근 매사추세츠 종합 브리검 의료 시스템 연구진은 HPV-DeepSeek이라는 새로운 액체 생검 기술을 개발해 HPV 관련 두경부암을 증상이 나타나기 최대 10년 전부터 진단할 수 있다는 연구 결과를 발표했다. HPV-DeepSeek은 전장 유전체 시퀀싱을 활용해 혈류 속에 존재하는 미세한 HPV DNA 조각을 검출하는 방식으로, 종양이 아주 초기 단계일 때에도 바이러스 관련 DNA를 탐지할 수 있다. 연구팀의 이전 데이터에 따르면 이 검사는 암 진단 시점에서 99%의 민감도와 99%의 특이도를 보여 기존 검사법보다 높은 정확성을 보였다.
이번 연구에서는 매사추세츠 종합 브리검 바이오뱅크에서 채취한 혈액 샘플 56개를 대상으로 시험을 진행했다. 이 중 절반은 수년 후 HPV 관련 두경부암이 발병한 환자의 샘플, 나머지 절반은 건강한 대조군이었다. 결과는 주목할 만했다. HPV-DeepSeek은 암 발병 환자의 샘플 28개 중 22개에서 이미 HPV 종양 DNA를 검출했으며, 대조군에서는 모두 음성으로 나타나 높은 특이도를 확인했다. 특히 가장 이른 양성 검출은 진단 7.8년 전 채취된 샘플에서 나타나, 실제 조기 진단 가능성을 보여주었다.


